Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms