Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rpusd2Q149F1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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