Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms