Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ubxn2bQ0KL01 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ubxn2bQ0KL01 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms