Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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