Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp2Q08652 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms