Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdx4Q07424 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms