Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms