Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms