Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms