Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin2bQ01097 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms