Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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