Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RhodP97348 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RhodP97348 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms