Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Irx2P81066 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Irx2P81066 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms