Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Usp9xP70398 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9xP70398 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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