Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acta1P68134 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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