Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms