Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PctpP53808 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PctpP53808 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms