Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lbx1P52955 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms