Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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