Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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