Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms