Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pax9P47242 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms