Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms