Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf5P43027 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms