Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc5P32043 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms