Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd28P31041 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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