Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrgP28705 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms