Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl3P27659 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms