Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 297 ms