Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Eif3aP23116 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eif3aP23116 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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