Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Spi1P17433 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Spi1P17433 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms