Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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