Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gabra6P16305 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms