Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms