Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms