Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P01649 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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P01649 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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P01649 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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P01649 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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P01649 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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P01649 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P01649 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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