Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl20O89093 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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