Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BlmO88700 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BlmO88700 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BlmO88700 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BlmO88700 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BlmO88700 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BlmO88700 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BlmO88700 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms