Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops6O88545 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cops6O88545 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops6O88545 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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