Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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