Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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