Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms