Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ldb2O55203 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ldb2O55203 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ldb2O55203 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms