Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Sdc4O35988 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sdc4O35988 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sdc4O35988 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sdc4O35988 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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