Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms