Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Clk2O35491 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clk2O35491 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clk2O35491 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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