Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smad6O35182 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smad6O35182 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smad6O35182 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smad6O35182 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms