Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 352.4 ms