Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms